《工作指引》明确各地要坚持统一领导，在省、市、县三级疫情防控指挥部门统一指挥、统一协调、统一调度下开展中医药防控救治工作；坚持多方协作，统筹调配优质中医药资源，建立完善国家、省、市、县各个层级中西医专家协同合作机制。

《工作指引》要求，各地要启动中医药参与疫情应急处置机制，包括完善中医应急医疗专家队伍协同合作机制，发生聚集性疫情时，省辖市至少组建1个市级专家组和1支中医应急队伍，做好本地或跨地区驰援准备；建立中药应急保障机制，原则上各省辖市辖区内中药储备不低于辖区人口2%的用量等。