项目建设目标为聚焦中医药重大科学问题或重大疑难疾病，以中医药发展重大需求为牵引，以海派中医流派独到的学术思想、鲜明的特色技术为切入点，以团队建设和人才培养为重点，遴选组建若干海派中医流派传承创新团队，以促进融合创新、团队实践为导向，用现代科学解读流派学术思想和特色技术基本原理，培育一批具有创新素质和能力的海派中医流派拔尖人才，促进流派传承发展，培育海派中医品牌。

项目可由具独立法人资格的医疗机构申报，机构应为“上海市海派中医流派传承研究基地”建设依托单位，且近5年牵头承担或完成相关领域国家级科技计划项目或课题，或获得过省部级一等奖及以上科技奖励，或在拟联合攻关的技术方向上拥有国内领先技术成果等。

项目建设周期内，流派传承创新团队应根据重大问题开展联合攻关（鼓励联合长三角地区相关流派），并取得国家级科研课题立项，获得具有较大临床应用价值的重大突破，取得在本学科领域有较大影响力的标志性成果，用现代科学解读中医药（流派学术思想和特色技术）原理。团队组成应包括2~3名非医学背景、2~3名现代医学背景以及4~5名中医药背景人员。探索建立中医药流派传承人认证制度，进一步完善师承学习模式，形成以传承人为主导的流派人才培养体系。