围绕中共中央、国务院此前印发的《横琴粤澳深度合作区建设总体方案》中发展科技研发和高端制造产业、中医药等澳门品牌工业、文旅会展商贸产业、现代金融产业，《条例》进一步细化支持促进四大产业的内容，强化人才、税收支持保障措施。

《条例》提出，合作区应当编制产业发展规划，发展促进澳门经济适度多元的新技术、新产业、新业态、新模式，重点发展科技研发和高端制造、中医药、文化旅游会展商贸、现代金融等产业。支持合作区建设中医药生产基地和创新高地，发展中医药服务贸易，建立具有自主知识产权和中国特色的医药创新研发与转化平台。在合作区生产的经澳门审批和注册的中医药产品、食品及保健食品，可以使用“澳门监造”“澳门监制”“澳门设计”标志。

《条例》明确，支持合作区发展休闲养生、康复医疗、健康管理、高端医疗服务等大健康产业。鼓励澳门医疗卫生服务提供主体在合作区内以独资、合资或者合作方式设置医疗机构。